A melhor coisa que você pode fazer nesta situação é tentar recuperar através de um sistema operacional de recuperação. Não precisa ser nada específico, mas você pode instalar o Ubuntu ao vivo em um pendrive. inicialize no modo ao vivo e monte seu sistema operacional anterior. Eu ficaria longe de mudar qualquer coisa no windows. você poderia introduzir finais de arquivos do MS e todo tipo de comportamento estranho.
Isso é principalmente para ajudar você a recuperar seus arquivos. porque como @SDsolar já disse, os backups são seu melhor amigo. Se você não fez nenhum backup, isso pode ajudá-lo a recuperar alguns arquivos.
heres o problema embora. você não pode simplesmente chutar tudo de volta. você deixará o sistema inutilizável, já que o usuário não tem permissões suficientes nos arquivos corretos, ou você introduz vulnerabilidades, já que o usuário tem acesso a algo que ele não deveria.
para realmente voltar ao jeito que era você teria que lembrar a propriedade de cada arquivo no sistema. isso é uma dor.
inicialize o live cd (se você não tiver backups) salve os arquivos. limpe a partição, reinstalar.