A questão é, obviamente, porque você acha que precisa reinstalar o seu sistema operacional - eu atualizei minha instalação do Debian Linux nos últimos 20 anos, mas nunca a reinstalei.
A criação de CDs de instalação é provavelmente impraticável, pois você precisará de CDs demais para instalar uma quantidade razoável de software. É muito melhor apenas escolher uma configuração e automatizar a instalação dos pacotes necessários.
Existem ferramentas como FAI (instalação totalmente automática) que visam a instalação de imagens indentais em muitas máquinas que fazem isso para uma ampla gama de Distribuições Linux. Mas é claro que também funcionará para uma única máquina.