Adicione ao seu comando de script que desative esta tarefa em caso de sucesso em algum lugar próximo a if exist Y:\ (...) and maps it otherwise net use Y: ...
schtasks.exe /CHANGE /TN "YourBatchScriptTask" /DISABLE
e adicione mais uma tarefa que permita "YourBatchScriptTask" no computador iniciar
schtasks.exe /CHANGE /TN "YourBatchScriptTask" /ENABLE
mas se fosse eu, eu manteria essa parte de "verificação", já que você não pode garantir que a conexão de rede com o seu NAS não seja quebrada. (suponha que algum gatinho tenha tocado com cabos Ethernet)