Sim. Deve funcionar. Placas-mãe modernas foram essencialmente padronizadas por anos, e o 6 + 2 significa apenas que você tem um pouco de bit de encaixe para que o mesmo conector funcione com menor consumo de energia e maiores requisitos de CPU.
O conector 6 + 2 iria para placas gráficas de maior capacidade, enquanto o conector 4 + 4 iria para o conector pequeno pela CPU.