Usando cmder, toda vez que tento executar uma das ferramentas msysgit (por exemplo, ls), recebo o seguinte erro:
0 [main] ls 7796 stdio_init: couldn't make stderr distinct from stdout
As mesmas ferramentas funcionam bem em cmd.exe e git-bash, então não consigo entender por que ele não funciona no cmder. O Cmder usa o ConEmu, o que também pode ser o problema.
Versão do cmder: 1.2
Versão ConEmu: visualização 20150513
Git para a versão do Windows: Git-1.9.5-preview20150319
Versão do Windows: 7 (64 bits)
Comando de tarefa Git:
"%ConEmuDrive%\Program Files\Git\usr\bin\bash.exe" --login -i -new_console
Seu problema provavelmente não está relacionado a ConEmu ou cmder.
Verifique se suas ferramentas (ls.exe) são usadas no mesmo local que o bash.exe. Verifique sua variável PATH.
Além disso, isso pode estar relacionado à variável TERM.
De qualquer forma, você observará o mesmo comportamento se executar o bash.exe do Win + R.