O Cisco Webex desativa uma função no Windows que permite janelas e barra de tarefas transparentes (no Vista, ela era chamada de Aero, não sei se esse ainda é o caso do Windows 7 e 10).
A razão disso é que o software foi projetado para permitir que as pessoas vejam sua tela, se necessário. Quando você está enviando sua tela para outra pessoa, a placa de vídeo não tem a chance de processar a saída como ela está sendo enviada através da rede também. Embora seja possível que um computador capture a saída da placa de vídeo, isso pode ser extremamente lento. Para cobrir a maioria dos cenários de casos de uso, o Webex apenas desativa a transparência.