Você pode redirecionar a saída do comando dir para findstr
para filtrar as linhas 'Thumbs.db'. O sinalizador /V
exibe apenas linhas não correspondentes, o sinalizador /I
torna a busca insensível ao caso. O comando completo seria:
dir /A:-D /B "x:\...\" | findstr /V /I "^Thumbs.db$"