Não, desculpe.
A largura de banda disponível a partir de um slot PCIe é determinada pela versão PCIe (neste caso, 2.0) e pelo número de "lanes" que possui. Cada "pista" no PCIe 2.0 oferece uma taxa de transferência de até 500 MB / s.
Seu slot "2.0 x16 (azul)" tem 16 pistas PCIe. Isso permite um rendimento de até 8 GB / s. (Isso é 16 vezes 500 MB / s.)
O seu "x16 (modo x4, preto)" slot é o tamanho do "2.0 x16 (azul)" slot, mas só tem quatro "pistas" PCIe nele. Isso é o que "modo x4" significa. Portanto, mesmo que seja capaz de aceitar fisicamente cartões x16, sua taxa de transferência será limitada a 2 GB / s.
Agora ... dependendo do que você está fazendo com o cartão, isso pode não importar. Mas se você estiver executando jogos de alto desempenho, espero que você perceba a diferença. Duvido que seria tão grave quanto uma redução na taxa de quadros para apenas 25%, mas uma redução para 50% não seria inesperada.
Eu provavelmente deveria mencionar que você já não está recebendo todo o desempenho daquele cartão pelo qual está pagando, porque é uma placa PCIe 3.0. O PCIe 3.0 fornece quase o dobro da taxa de transferência por pista que o PCIe 2.0 (985 MB / s por faixa vs. 500). Os testes que você pode ter visto para o desempenho da placa assumem que você a está usando em um slot PCIe 3.0. Portanto, ele não será executado tão rápido quanto indicado nesses relatórios em um slot 2.0. A maioria das placas de vídeo na maioria das aplicações não está realmente usando todas as ofertas de PCIe de largura de banda, então a diferença pode não importar muito, mas é algo para se ter em mente. A única maneira de consertar isso é obter uma placa-mãe que tenha o PCIe 3.0. (Enquanto você está nisso, você pode obter um no qual uma placa PCIe x16 longa não bloqueará as portas SATA.))