Eu instalei o ffmpeg (não o ffmpeg-php)
Agora posso executar um comando como este?:
exect('ffmpeg -i begin.mp4 end.ogg');
Meu provedor de servidor me disse que eu não poderia executar este comando em php por causa do ffmpeg-php! Mas eu acho que está errado
O ffmpeg-php é usado para recuperar informações e executar várias tarefas nos arquivos de maneira programática. Tudo o que você está fazendo com um exec(...) está chamando um binário externo. Contanto que você tenha ffmpeg (não a extensão php) instalado, você pode exec() it.
Veja também FFmpeg Wiki: Usando o FFmpeg a partir de scripts PHP .
O seu provedor de serviços informou isso porque é improvável que eles permitam que seus scripts PHP executem um arquivo externo ou um número limitado deles. Isso é muito comum em um ambiente de hospedagem compartilhada.