Use o comando chmod para alterar as permissões. O comando que você deseja é mais provável:
chmod 701 ~
Em que 701 é o nível de permissão que você deseja definir e ~ é o diretório (ou arquivo) ao qual você deseja aplicar a permissão.
Você pode precisar aplicar essa permissão também a subdiretórios (por exemplo, qualquer public_html ou diretório semelhante). Isso é feito da mesma maneira.
Aqui está a página man para chmod. Em sistemas Unix, você pode usar o comando man para aprenda o que um comando específico faz e como usá-lo.