Substituir células vazias por "NoData" é uma tarefa trivial.
Basta selecionar todas as células e, a partir da faixa de opções "Início", escolha Localizar & Selecione e, em seguida, Substituir.
Deixe a caixa "Localizar" vazia. Para "Substituir por", digite NoData. Clique em Opções e marque a opção "Corresponder todo o conteúdo da célula". Clique em Substituir Tudo.
Em seguida, salve como CSV - pronto!