Encontre o identificador do site que você deseja iniciar / parar:
Em seguida, em um prompt de comando:
cscript //nologo C:\Inetpub\AdminScripts\adsutil.vbs start_server w3svc/IDENTIFIER
cscript //nologo C:\Inetpub\AdminScripts\adsutil.vbs stop_server w3svc/IDENTIFIER