Esta foi a primeira vez que tentei exportar em segundo plano e funcionou para mim. Como minha variável org-export-run-in-background é nula, tive que testá-la via 'C-u C-u C-c C-e'.
Eu vi o seu erro antes, quando a minha sessão anterior do Emacs foi desligada incorretamente e a próxima sessão achou que já havia um servidor em execução. Eu tentaria seguir a recomendação de chamar 'M-x server-force-delete' e, em seguida, garantir que seu servidor está sendo executado via 'M-x server-start'. Depois disso, tente novamente sua exportação.
Se você ainda estiver com problemas, verifique quais processos ainda estão sendo executados. Eu uso um par de métodos: 1. Método Emacs de executar 'M-x list-processes' ou um comando bash shell de "pstree -lp $ (pgrep emacs)".