Se você está falando USB 2, não se incomode. Por outro lado, o USB 3 pode fazer a diferença. Sua milhagem pode variar, dependendo de vários fatores, incluindo fragmentação, sistema de arquivos, tamanho do arquivo, etc.
Eu tenho um disco rígido USB externo que eu uso com o VirtualBox (a VM tem acesso exclusivo ao disco). É um disco IDE. Eu recentemente entrei em posse de um disco rígido SATA do mesmo tamanho.
Como o SATA é mais recente, imaginei que valeria a pena copiar os dados e usar o disco SATA. Mas talvez passar por USB cancelará alguma vantagem? (As pontes IDE e SATA são USB 2.0, não 3.0.)
Não estou preocupado em conseguir duplicar a unidade com sucesso; Eu estou querendo saber se alguém aqui pode me poupar o trabalho de um experimento demorado.