Isso dependeria inteiramente da placa de vídeo dedicada que você colocou no sistema, mas, em geral, não. Uma placa de vídeo dedicada geraria mais calor, já que seria uma GPU mais potente e trabalharia mais para fornecer uma exibição melhor.
Agora "a maior parte da carga de trabalho é transferida para ela" ... não precisa. Primeiro, estamos falando sobre a mais nova geração de processadores Intel e AMD que possuem GPUs embutidas no CPUS real? Ou estamos falando de sistemas mais antigos, onde há uma GPU integrada no design da placa-mãe? Porque para o propósito do que você está falando, são maçãs e laranjas.
Nos sistemas em que a CPU e a GPU são separadas, mas a GPU faz parte da placa-mãe, ainda existe uma GPU separada que gera seu próprio calor e faz seu próprio trabalho. Há evidências empíricas para sugerir que, em um sistema integrado como esse, a CPU funcionará mais, mas nenhum resultado real de testes de benchmark foi publicado para provar isso.
Então, você tem uma GPU integrada, menor e mais fraca, produzindo calor em uma mão, e você tem a placa de vídeo dedicada, maior e mais poderosa, produzindo calor na outra.
Pense desta maneira. Em sistemas com uma GPU integrada, você pode ver um dissipador de calor, mas raramente vê um ventilador naquele dissipador de calor. Em relação às placas de vídeo, você raramente vê placas de vídeo sem fãs hoje. Por quê? Eles geram uma tonelada de calor.