O mouse se acende significa que há energia, mas não necessariamente que você tenha comunicação com o sistema.
Eu provavelmente começaria verificando se o X realmente detecta o mouse com xinput list e verificando se a entrada do mouse é detectada usando evtest - se um deles falhar, o problema pode estar no nível inferior, possivelmente relacionado a evdev.
Se ambos funcionarem, isso pode ser relacionado ao xconf - talvez crie um backup para o seu arquivo xorg.conf se você tiver um, e crie um arquivo genérico com sudo Xorg -configure (ou apenas certifique-se de que não há um , como com as versões mais recentes do Ubuntu)
Também pode ajudar se você soubesse exatamente o que aconteceu antes de parar de funcionar.
Você pode ter algumas idéias sobre o que fazer com a página de configuração de entrada X do Ubuntu