De acordo com sua atualização em relação ao iptraf, isso é comum em qualquer aplicativo de console que atualize grandes partes da tela regularmente.
Uma solução para deixar essas coisas em execução é executá-las pela tela (disponível em praticamente qualquer Linux distribuição) ou similar ( tmux é uma alternativa popular, embora não tão amplamente disponível em repositórios padrão, então você pode precisar compilá-lo ). Ter a ferramenta em execução em uma tela "janela" e uma concha ociosa em outra, deixar a inativa ligada normalmente e alternar quando você quiser olhar para a saída da ferramenta por um tempo curto. Você pode até mesmo fazer o logoff completo e deixar a (s) ferramenta (s) em execução para que você possa fazer login novamente mais tarde e encontrá-los ainda lá fazendo seu trabalho.