Você pode usar sed
para alterar a string do nome do arquivo:
echo $filename | sed -r 's/^([a-zA-Z]{3})([0-9]{3})$/.blah./'
Isso significa: Pegue os 3 primeiros caracteres da string, se forem letras, adicione a string '.blah'. e adicione os 3 últimos caracteres da string, se forem números.
Se você, por exemplo, deseja renomear o arquivo que você pode fazer:
mv "$filename" "'echo $filename | sed -r 's/(^[a-zA-Z]{3})([0-9]{3})$/.blah./''"