Sim, deve funcionar.
Minha referência favorita para esse tipo de pergunta é Lista de taxas de bits de dispositivos na Wikipedia. De acordo com essa página, a forma mais lenta do PCI Express (1.0 x1) suporta 2 Gbit / s, enquanto o USB 3.0 suporta até 5 Gbit / s. Então, em teoria, o slot PCI Express poderia ser um fator limitante.
Na prática, nenhum disco rígido mecânico vai saturar um link de 2 Gbit / s, então eu não me preocuparia com isso.
Qualquer placa de expansão PCIe funcionará em qualquer slot PCIe, desde que o slot seja "amplo" o suficiente; uma placa x1 funcionará em um slot x16, mas não o contrário. A taxa de transferência e o número de faixas ativas são negociados automaticamente.
Se você nunca viu o interior do seu computador, agora seria um bom momento. Você terá que abri-lo de qualquer maneira para instalar o cartão, então porque não olhar para onde você está planejando instalá-lo. Não fazer isso é como comprar um sofá sem pensar em onde você vai colocá-lo. Se você olhar por si mesmo, não precisa adivinhar o que o CPU-Z está lhe dizendo, e você verá se há alguma limitação física ou algum cartão antigo esquecido naquele slot.