Dois comentários:
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Os endereços do site local foram preteridos por algum tempo. Você deve usar Unique-Local-Addresses (ULA), RFC 4193 . Você pode gerar você mesmo, mas o site SixXS tem um bom gerador.
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Se você deseja executar serviços em endereços IP, isso significa que você precisará pelo menos colocar esses endereços em configurações ao configurar os serviços, colocar esses endereços no DNS etc. Se você permitir que o sistema configure automaticamente os endereços no sistema, você corre o risco de que os endereços mudem inesperadamente.
Eu vi isso acontecer. Um servidor teve uma falha de hardware, então alguns hardwares foram substituídos, incluindo os adaptadores de rede. Como a configuração automática depende dos endereços MAC dos adaptadores de rede, os endereços IPv6 também mudam de repente. O administrador de sistemas não percebeu que ele tinha que reconfigurar os serviços, atualizar os registros de DNS, etc. Então os serviços foram quebrados ...
Então: o melhor a fazer é usar os endereços ULA e configurá-los estaticamente nos servidores.