Se você usa o Adobe Reader, abra Edit - > Preferences , selecione a categoria Internet e desmarque Display PDF in browser
No Ubuntu, o Firefox não abre PDFs. Em vez disso, faz o download deles e eles abrem no Evince. Existe alguma maneira de fazer o Windows se comportar da mesma maneira (para qualquer navegador: eu uso um monte de diferentes no Windows)? Eu prefiro ter PDFs em uma janela separada. (A menos que, talvez, alguém esteja colocando um PDF em um HTML frame ou iframe , mas isso é raro.)
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Desative o recurso no seu programa de visualização de PDF. Para o Adobe Reader, desmarque a caixa "Exibir PDF no navegador" na categoria Internet. Outros leitores terão uma opção semelhante.