Você pode simplesmente adicionar inglês americano (ou qualquer outro layout sem ALTGr) às configurações de entrada de texto.
Em seguida, use o Super + Space padrão para usar o Emacs com as teclas de atalho dos EUA. Infelizmente, você não poderá usar caracteres locais específicos do seu país.
Infelizmente, você não pode apenas reconfigurar o ALTGr para ALT através do init do emacs. Alterar seu mapa de xkb seria uma solução, mas você não queria isso. Essa solução é mais orientada por GUI. Aproveite.