Você terá que mudar os modos nos diretórios e arquivos que você quer escrever.
Parece que, de alguma forma, você instalou o netbeans durante a execução como um usuário diferente de você (supostamente root) e, portanto, os locais para os quais deseja gravar não são graváveis.
A melhor solução seria descomprimir e instalar o netbeans como você, então ele terá acesso suficiente. Se você não pode fazer isso, você pode obter melhores resultados usando chgrp para colocar o material do netbeans em um grupo em que você está (o comando groups irá dizer quais são aqueles) e então chmod g + w para escrever o grupo.