Isso geralmente ocorre quando a planilha anteriormente tinha algumas células nessas colunas que tinham valores / fórmulas e foram excluídas.
Você está começando com alguns arquivos básicos e editando / adicionando dados? Tente garantir que a planilha básica tenha essas colunas totalmente limpas.
Talvez uma macro que use a seleção atual como o intervalo da coluna para salvar em CSV?
Informações sobre como você está gerando a planilha, salvando-a e interagindo com o usuário final seriam úteis para uma solução.