Primeiro, você pode tentar iniciar no modo de usuário único. Interrompa o processo de inicialização na tela do carregador do GRUB, pressionando 'enter'. Em seguida, edite a linha de inicialização e coloque a palavra 'single' no final dessa linha do kernel. Em seguida, inicialize e ele fornecerá um prompt de login. Conecte suas credenciais de raiz e isso lhe dará um shell.
A tela da GUI que você estava modificando faz alterações em /etc/gdm/custom.conf. Então verifique esse arquivo depois de ter acesso. Talvez seja necessário certificar-se de que "AllowRoot" esteja indefinido ou definido como "true", para que o usuário root possa efetuar login. Há também "AutomaticLoginEnabled" que é definido como 'true' se logins automáticos estiverem em uso.