Essa configuração apenas define as permissões nos arquivos e pastas na pasta no momento em que você clica para definir essas permissões. As propriedades da pasta são para controlar o que os usuários podem e não podem fazer. Que tipo de arquivos você está tentando colocar lá que você gostaria de definir as permissões para? O que quero dizer é que eles vêm de um aplicativo ou você os copia lá dentro?