O software que não é instalado por meios regulares geralmente entra em /opt
.
Para disponibilizar os comandos no bash, você pode adicionar o diretório com os executáveis ao caminho sem curingas (o que, de alguma forma, significa uma entrada para cada software adicionado).
Outra solução é adicionar um pequeno script de inicialização ou um link para o executável no seu ~/bin
(seu ~/bin
é normalmente incluído no caminho, se existir).