Sim.
Se você está planejando manter o HDD como backup, mas não fazendo nenhuma conexão com a máquina (SATA), não há nenhum propósito de ter energia conectada.
Você precisará abrir sua máquina para conectar, independentemente disso.
Apesar de degradar, não vale a pena se preocupar porque o trabalho real é feito em Leitura / Escrita. Dos quais, você não estará fazendo se você só tiver energia conectada.
@computercarguy também faz um ponto válido de possíveis falhas de energia ou surtos que causam falha no motor. Qual é outro bom motivo para considerar deixar o HDD sobressalente desconectado até que seja necessário.