Is this a definitive test of whether or not a USB device is clean of any malicious applications or files?
Portanto, sua pergunta é "É ls -al equivalente ao melhor verificador de vírus?". Não, não, não é .
Os autores de malware são inteligentes, não existe um teste definitivo para malware.
Quanto a ls -al mesmo lista "todos e quaisquer arquivos que possam existir no dispositivo", bem, depende da sua definição de "todos os arquivos que possam existir". Se você incluir abusos no sistema de arquivos para que o arquivo apareça nos drivers personalizados, mas pareça com uma memória não inicializada para os drivers de ações, não, ls -al não os listará.