O arquivo realmente parece ser um arquivo zip. Eu não tenho idéia porque você está tendo esse problema. Parece uma limitação de unzip , mas, de novo, é muito improvável. De qualquer forma, uma solução possível é usar zcat . No entanto, isso só funcionará como esperado se os dados compactados forem um único arquivo , não um monte de arquivos e diretórios:
zcat file.zip > file.unzipped
A outra opção, claro, é que o arquivo está corrompido (você diz que não está em seu comentário, mas não fornece evidências para apoiar a reivindicação) ou parte de um arquivo maior. Sem mais informações sobre o arquivo em si, não podemos ajudar.