Talvez você possa relatar um bug de acessibilidade solicitando que o Ctrl não seja codificado, para que você possa escolher qualquer atalho ou chave não usada desejada.
Outra opção pode ser pedir aos desenvolvedores do Compiz para criar uma alternativa menos espetacular para seus atuais efeitos "encontrar o ponteiro".
Como alternativa, você pode alterar o ponteiro do mouse para algo como o tema de ponteiro "redglass" (que, como bônus, também permite definir o tamanho do ponteiro). Você pode fazer isso na caixa de diálogo Aparência, clicar no botão Personalizar e, em seguida, na guia Ponteiro. Você pode experimentar outros temas também.