Não tenho certeza sobre o MobaXterm, mas sei que o PuTTY armazena as impressões SSH do servidor no registro, e algumas versões dificultaram a conexão a um servidor se a impressão digital tivesse mudado (e não fossem muito detalhadas em suas saída de diagnóstico).
Poderia ser que a impressão digital do seu servidor tenha mudado e o seu programa de terminal esteja protegendo você de coisas ruins?