Eu comprei um novo PC customizado de um cara e depois de aproximadamente um ano de uso eu quero saber se restaurá-lo para as configurações de fábrica me fará ter que configurar ou recalibrar o CPU, GPU, sistema de resfriamento líquido etc. Como eu vou ter que encontrar o meu DVD do Windows 10 e reinstalar o Windows com o número de série, etc? Esse computador veio sem nenhum ponto de restauração e continua excluindo o meu e desativando a restauração do sistema.
Você não precisa se preocupar com nada. Como @bwDraco mencionou tudo o que você vai ter que fazer após a limpeza é reinstalar seus drivers para tudo (GPU, placas de som, placas WiFi, unidades de DVD, ratos, teclados, etc). Você estará essencialmente passando pelo mesmo processo que a instalação de uma unidade de armazenamento limpa implicaria.
Também em uma nota lateral, se você estiver indo para limpar instalar o Windows e não tiver um SSD agora seria um ótimo momento para atualizar para um.
A atualização do sistema operacional do seu PC é segura, contanto que você ainda tenha os drivers, não deve haver problemas. O Windows exibirá todos os aplicativos removidos em um arquivo do Internet Explorer que será localizado em sua área de trabalho. Você pode visualizá-lo se não tiver certeza de quais são os aplicativos instalados no sistema operacional quando ele ainda está funcionando.