Você não pode voltar diretamente ao Glacier com Borg.
Você pode fazer backup localmente e usar os comandos do AWS S3 para fazer upload para o S3 ou um script do tipo "S3 drive". A partir daí, você pode usar as regras de ciclo de vida do S3 para mover os arquivos para o Glacier. Pessoalmente eu uso um script para fazer o upload dos arquivos para o Dropbox, porque eu queria meus backups em um local / empresa diferente no caso de minha conta da AWS ficar inacessível por algum motivo.
O esquema de backup que você sugeriu pode desperdiçar espaço em disco, se feito da maneira mais simples. Tanto o Borg quanto o Attic removem os arquivos de backup para atender ao seu agendamento de backup configurado. Por exemplo, ele pode manter backups diários por uma semana, depois backups semanais por seis meses, depois backups mensais. Assim, com o tempo, os arquivos de backup criados são removidos no sistema de arquivos local. Se você arquivar tudo no Glacier, você terá muitos arquivos que não são realmente necessários. Não faz mal, mas vai te custar dinheiro.
Eu não tenho uma ótima solução. Você pode sincronizar seus arquivos, mas isso significa que, se ocorrer um vírus ou um acidente e sincronizá-los, você poderá perder seus backups. Minha solução deselegante é excluir manualmente arquivos estranhos ocasionalmente, mas isso não seria escalável. Interessado em sugestões para melhorá-lo.
Atualização: publiquei meu guia para fazer backup do AW2 EC2 para o Dropbox , que também funcionaria para fazer o backup em outros destinos.