Você ainda deve conseguir instalar o Windows com um disco rígido vazio.
Você precisará verificar o BIOS para desativar configurações como 'Inicialização segura' e 'Inicialização rápida' - se a sua BIOS suportar UEFI, talvez seja necessário selecionar a opção alternativa ou ativar 'Legacy Boot' ou 'Legacy BIOS' . Todas essas configurações podem ser alteradas novamente depois de instaladas. Certifique-se de que a inicialização USB esteja no topo das opções de inicialização e tenha certeza de salvar suas alterações!
Quando você diz que não consegue reinstalar o Windows, é possível detectar o USB após o BIOS?