Não consigo pensar em uma maneira de fazer isso, porque quando a webcam está ativada, o computador não está no modo inativo, pois está recebendo dados de um dispositivo periférico. O Skype não tem como saber se você está na frente da webcam ou não, só pode detectar se a webcam está ativada ou desativada.
Se você fez isso, e diz que defina o protetor de tela para depois de 30 minutos, o protetor de tela iniciaria a cada 30 minutos se você não tivesse algum tipo de entrada para o PC (movimento do mouse, ajuste de volume, etc). Isso seria meio chato se você me perguntar.
Você pode criar um atalho na área de trabalho para iniciar o protetor de tela. Em seguida, você teria que iniciar manualmente o protetor de tela cada vez que você se levantou e quer começar a usar uma proteção de tela. No entanto, acredito que a webcam continuaria a rodar, para que a outra pessoa pudesse ver tudo, mas do seu ponto de vista ela mostraria seu protetor de tela.
A coisa mais fácil de fazer, seria desligar a webcam antes de se levantar e ir embora.