Acredito que reduzi a duas expressões encontrar / substituir.
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1,"abc",,,,
2,"def",,,"ghi",
3,,"jkl",,,"mno"
Encontre o que: ^([^,]*),([^,]*),([^,]*),([^,]*),([^,]*),([^,]*)$
Substitua por: VALUES\(NULL,NULL,NULL,NULL,NULL,NULL\);
VALUES(NULL1,NULL"abc",NULL,NULL,NULL,NULL);
VALUES(NULL2,NULL"def",NULL,NULL,NULL"ghi",NULL);
VALUES(NULL3,NULL,NULL"jkl",NULL,NULL,NULL"mno");
Encontre o que: NULL([^,\)])
Substitua por:
VALUES(1,"abc",NULL,NULL,NULL,NULL);
VALUES(2,"def",NULL,NULL,"ghi",NULL);
VALUES(3,NULL,"jkl",NULL,NULL,"mno");