but this particular file does not want to copy and paste for some reason
Isso parece impossível. Com a massa, você seleciona a parte que deseja com o mouse e ela é salva automaticamente na área de transferência. Depois, basta colá-la em outro lugar com Control v
este método é recomendado: você pode executar python -m SimpleHTTPServer 8080
do PuTTY para iniciar um servidor HTTP simples, então use o seu navegador para abrir o link , você verá uma lista de arquivos do diretório a partir do qual você executa o comando python. então você pode baixar o arquivo via HTTP.
Ou você pode usar filezilla
ou winscp
para fazer o download do arquivo.