Se o AV não conseguir limpar os arquivos significa, em sua maioria, será spyware ou malware. Aqueles podem me remover fazendo a varredura de boot. Se o sistema foi inicializado, será difícil acessar esses arquivos, mesmo se alterarmos a permissão. Por isso eu recomendo executar a verificação de inicialização para remover esses spywares. Há muito spyware mais limpo disponível que pode ser feito na inicialização e removerá o spyware do seu computador.