Sim, é possível ...
... pelo menos para aplicativos GTK como lxterminal, pcmanfm e abiword.
Seja no Lubuntu, Xubuntu ou Ubuntu, Chromium / Chrome, Firefox, Opera e Seamonkey são navegadores que atualmente não suportam barras de rolagem de sobreposição. Midori e Web (Epifania) fazem. O LibreOffice, a suíte de escritório, também não os suporta.
como fazer
Basta instalar o pacote overlay-scrollbar
, efetuar logout e login
sudo apt-get install overlay-scrollbar