Infelizmente, acho que a resposta é sim:
# dd if=/dev/zero of=test bs=1M count=640
640+0 records in
640+0 records out
671088640 bytes (671 MB) copied, 0.396043 s, 1.7 GB/s
# LODEV=$(losetup -f --show test)
# echo $LODEV
/dev/loop0
# blkid $LODEV
# mkfs.ext4 -q $LODEV
# blkid $LODEV
/dev/loop0: UUID="f495c785-4b12-464f-b477-9320b1a1d3d7" TYPE="ext4"
# btrfs-convert $LODEV
creating btrfs metadata.
creating ext2fs image file.
cleaning up system chunk.
conversion complete.
# blkid $LODEV
/dev/loop0: UUID="e872e338-ad47-4584-813f-ede58c734d4e" UUID_SUB="998cd182-5f72-4066-b419-fe7c381b608d" TYPE="btrfs"
# losetup -d $LODEV
# rm test
#
No dump acima, o uuid foi alterado durante a conversão. E btrfs-convert não parece ter nenhum parâmetro de comando útil (de uma rápida olhada @) que impediria isso.
Btw, O wiki de ajuda do Ubuntu menciona (ou melhor, implica) a mudança do uuid durante a conversão do ext3 / 4, também.