Você pode tentar os comandos abaixo para instalar o mysql não-interativamente
sudo debconf-set-selections <<< 'mysql-server mysql-server/root_password password your_password'
sudo debconf-set-selections <<< 'mysql-server mysql-server/root_password_again password your_password'
sudo apt-get -y install mysql-server
Você precisa do debconf-utils instalado em seu sistema
sudo apt-get install debconf-utils