O outro programa é um arenque vermelho. O Blender está perfeitamente feliz com o arquivo de vídeo modificado. O bit importante é "Nas propriedades da Visualização do Editor de Seqüência de Vídeo em 'Configurações de Visualização', configurei 'Proxy rend' como 'Tamanho do Proxy de 25%' para acelerar as visualizações." Uma vez feito isso, você precisa criar proxies para seus arquivos de vídeo.
Quando adicionei os arquivos de vídeo originais, abri as propriedades de cada faixa e marquei "Proxy / Timecode" e "25" (para 25%). Quando adicionei o arquivo adicional, esqueci que precisava verificar essas opções e executar o Strip > Reconstruir índices proxy e timecode. Depois que fiz isso, funcionou como esperado.