Eu recomendo strongmente que você desinfete sua máquina. Tente baixar e instalar um antivírus em breve. Deve ser a melhor solução.
Se você ainda quiser impedir que seus arquivos / pastas fiquem invisíveis sem qualquer antivírus, você pode proteger o seu usb através da opção de registro do windows. Ele negará o acesso ao malware que faz o problema da invisibilidade. Eu vou te ajudar a escrever proteja seu usb aqui.
Escreve protegendo o usb através do editor de registro do windows ...
- abra a janela de execução usando a tecla win + r.
- digite regedit e pressione Enter para abrir a janela do editor de registro.
- procure HKEY_LOCAL_MACHINE no painel esquerdo e insira-o
- procure Sistema e entre nele
- procure por CurrentControlSet e entre nela
- procure Controle e clique com o botão direito do mouse
- Novo - > Chave para criar uma nova pasta dentro do Controle
- renomeie a pasta como StorageDevicePolicies
- clique com o botão direito do mouse em StorageDevicePolicies
- Novo - > Valor DWORD (32 bits) para criar um novo REG_DWORD no painel direito
- renomeie o novo REG_DWORD no painel direito para WriteProtect
- clique com o botão direito do mouse em WriteProtect e escolha Modificar para abrir a janela Editar o D-WORD
- na janela aberta, procure Dados do valor e altere-os para 1
- fecha a janela do editor de registro
É isso. Você terminou. O acesso ao malware em seu pendrive será negado. Então, não esconde e procura agora :)