Seus discos rígidos estão conectados à conexão IDE? Desde que você está usando 8,1 isso é muito improvável. Se não, você deve estar usando discos rígidos SATA e SATA não tem essa relação mestre-escravo. Você pode apenas instalar o Windows em ambos os HDDs e trocar entre alterando a ordem de inicialização do BIOS.
Então, todas as suas respostas seriam: Sim.