Bem ... não há muita escolha além dessas duas, infelizmente. A Intel é mestra na frente de código aberto com excelentes drivers de código aberto. Mas eles realmente não têm soluções gráficas para PCs de mesa que não sejam gráficos embutidos em seus processadores.
A Nvidia tem ótimos drivers proprietários. Eu nunca tive problemas com eles e o desempenho em 3D é ótimo. Os jogos Steam são executados sem falhas e o desempenho da área de trabalho também.
A AMD, por outro lado, depende do seu cartão. Se você tem um cartão mais antigo que o da série HD 4000 do que você fica no escuro quando se trata de suporte proprietário. Seus drivers legados não funcionam bem em novos lançamentos do Ubuntu. Seus drivers de código aberto são muito bons, especialmente com o mais novo Kernel do Linux, onde eles finalmente adicionaram gerenciamento dinâmico de energia! Se você usar um novo cartão (HD 5000 ou superior) do que é o contrário: grandes drivers proprietários, mas os drivers de código aberto ainda não estão lá ...
Então essa é basicamente a minha experiência com placas de vídeo no Linux ...: P