Um pequeno googling para stanza ios
trouxe "Farewell, Stanza. Olá, Marvin! | Emptybottle.org", que faz referência a um aplicativo chamado "Marvin", que se sublinhou com "Seus livros, em todos os lugares.
Dropbox. iTunes. Rede. OPDS. calibre. "Veja link
Em geral: Nem todos os arquivos podem ser baixados para o IOS via Safari (principalmente porque você não tem uma pasta de download real onde todas as porcarias baixadas permanecem até a eternidade; seguidas pelo fato de você precisar de um aplicativo para visualizar as coisas que você baixou e os aplicativos mais relevantes fazem o download de 'suas' coisas por conta própria, seguidos pelo fato de que a Apple quer que você use o iTunes para sincronizar seus produtos digitais que os colocariam nos lugares apropriados). Dito isso: eu brinquei com o IOS8 e baixei um .epub de um servidor Web via Safari e agora o Safari me pergunta se eu quero abrir o .epub no iBooks. E isso funciona.
Então, a resposta para o seu "A Apple baniu o download do EPUBS?" pergunta é "Não".