Inspecione o Notepad ++ em execução nos dois casos com o Process Explorer assim:
Verifique o campo Diretório atual . Isso pode lhe dar uma pista do que está acontecendo.
Solução alternativa:
Em vez de Enviar para , clique com o botão direito do mouse em Shift e escolha o item de menu de contexto Copiar como caminho . No Notepad ++, pressione Ctrl + O (abra o arquivo), Ctrl + V (copie o caminho copiado) e < kbd> Enter e está pronto.