É um bug conhecido, você deve fazer o upvote do bug aqui:
para que receba mais atenção.
SO: Ubuntu 12.04 Cartão Grafic: Nvidia GTX 9800+ Primeiro Monitor: View Sonic 1920x1080 Segundo Monitor: Samsung 1280x1024 Nas definições do NVidia X Server, defina "Separate X screen" com a opção Xinerama Tudo funciona, mas o painel se torna preto (sem opacidade), em alguns aplicativos (firefox, configurações do servidor NVIDIA X, etc.), decoração de janela se tornar clássico, mas no nautilus como em configurações "Ambiance", quando mova mouse entre monitores no mouse View Sonic posição inicial padding-left 1280px). Alguma idéia de como consertar ou onde e-mail?
P.S. Versão do driver NVidia 295.40.