Isso depende de como o Notepad ++ foi configurado. Se ele foi configurado usando as opções padrão, os arquivos estarão todos em% APPDATA% \ notepad ++ -% APPDATA% é uma variável de ambiente que muda entre as versões do Windows, mas pode ser inserida no início: Executar ... (digite start% APPDATA% na caixa de diálogo Iniciar: Executar .. para abrir a pasta no explorador - a barra de endereços na parte superior mostrará onde está. echo% APPDATA% na linha de comando também lhe dirá.
Existe uma opção de instalação "Não use% APPDATA% ', o que faz com que coloque os arquivos de configuração no diretório de instalação (principalmente para instalações portáteis) - se isso foi selecionado, os arquivos estarão onde o executável estiver.